ブログ引っ越し

茨城大学農学部生物制御化学研究室ブログ「生物制御化学研究室の日々」は Blogger から大学のウェブサーバーでのホストに切り替えます．Blogger の方はこのまま残しておきますが，これ以降の更新は新ブログをご覧ください．

イネのフィトアレキシンに関する文献リスト

 研究室のウェブサイトでは，イネのフィトアレキシンに関する文献リストを作成して公開しています．このリストを 2 年以上更新していなかったのですが，ブログ同様にリストの更新も再開しました．このリストに出している論文（原著論文・総説論文）は私の主観で選んだイネのフィトアレキシン関連文献です．ずばりイネのフィトアレキシンを研究対象としている論文だけでなく，イネのフィトアレキシンとして知られる化合物がとにかく出ている論文や，トランスクリプトーム解析の結果でイネフィトアレキシン生合成遺伝子に注目している論文なども含めています．

フィトアレキシン生合成遺伝子が同定され始めてからは，論文の数もかなり増えているので，おそらくかなり抜けているものがあると思いますが，今日現在 361 報がリストされています．一部，内容の簡単な解説を載せているものもありますが，とても全部に解説を書く余裕はないので，最近は単にリストするだけになってしまっています．今後も論文を見つけ次第追記していきます．当研究室からの発表論文をこれからも掲載できるように成果を出していくことも必要だと思っています．

新年度・久しぶりに研究室ホームページとブログを更新

2021 年度の生物制御化学研究室の学生は M2 2 名，M1 1 名，4 年生 3 名という体制になりました．昨年度の M2 4 名，M1 2 名，4 年生 5 名からは大きく減ったので，学生居室のスペースが余裕です．

このブログは実に久しぶりの更新になってしまいました．研究室のホームページも丸二年更新していなかったのですが，更新を再開しました．しかし，二年も更新していないと，ソフトウェアの環境も変化していて，BiNDup はスタンドアローンのデスクトップアプリケーションのバージョンアップを停止しているし，MarsEdit は Blogger のサポートを廃止しているしで，更新環境を考え直さなければならなくなっています．

大学前の県道竜ヶ崎阿見線（茨大通り）の桜（3/31 撮影）

4/3 〜 7/7 の輪読

また長いことブログの更新をサボってしまいました．ブログエディタとして macOS の Blogo というソフトを使っているのですが，このソフトを 4 月にアップデートしてからコピペがうまくいかなくなってしまいました．そのうち改善されるかと思って放置していたのですが，いつまでたっても改善されないので，諦めて Blogger のウェブで更新することにしました．

4/3 〜 7/7 の輪読では下記の論文を取り上げました．第 1 クォーター（4/7 〜 6/8）は長谷川は水戸での授業があったので，輪読は週 4 回実施でした．

1124. Klein, A.P., and Sattely, E.S. (2017). Biosynthesis of cabbage phytoalexins from indole glucosinolate. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 114: 1910–1915.

1125. Takei, M., Ito, S., Tanaka, K., Ishige, T., and Suzuki, Y. (2017). Transcriptomic characterization of gall tissue of Japanese elm tree (Ulmus davidiana var. japonica) induced by the aphid Tetraneura nigriabdominalis. Biosci. Biotechnol. Biochem. 81: 1069–1077.

1126. Deng, Y. et al. (2017). Epigenetic regulation of antagonistic receptors confers rice blast resistance with yield balance. Science 355: 962–965.

1127. Wang, J. et al. (2014). Helicoverpa zea gut-associated bacteria indirectly induce defenses in tomato by triggering a salivary elicitor(s). New Phytol. 214: 1294–1306.

1128. Li, C. et al. (2017). MoCDC14 is important for septation during conidiation and appressorium formation in Magnaporthe oryzae. Mol. Plant Pathol. in press.

1129. Yuan, H.-M., Liu, W.-C., and Lu, Y.-T. (2017). CATALASE2 coordinates SA-mediated repression of both auxin accumulation and JA biosynthesis in plant defenses. Cell Host Microbe 21: 143–155.

1130. Li, Q. et al. (2017). Transporter-mediated nuclear entry of jasmonoyl-isoleucine is essential for jasmonate signaling. Mol. Plant 10: 695–708.

1131. Song, Y. et al. (2017). Biotransformation of 20(R)-panaxatriol by Aspergillus niger AS 3.739. Phytochem. Lett. 19: 89–93.

1132. Jia, M., Zhou, K., Tufts, S., Schulte, S., and Peters, R.J. (2017). A pair of residues that interactively affect diterpene synthase product outcome. ACS Chem. Biol. 12: 862–867.

1133. Ma, Z. et al. (2017). A paralogous decoy protects Phytophthora sojae apoplastic effector PsXEG1 from a host inhibitor. Science 355: 710–714.

1134. Belt, K. et al. (2017). Salicylic acid-dependent plant stress signalling via mitochondrial succinate dehydrogenase. Plant Physiol. 173: 2029–2040.

1135. Wang, X., Li, C., Zhou, C., Li, J., and Zhang, Y. (2017). Molecular characterization of the C-glucosylation for puerarin biosynthesis in Pueraria lobata. Plant J. 90: 535–546.

1136. Enomoto, H. et al. (2017). Visualisation of abscisic acid and 12-oxo-phytodienoic acid in immature Phaseolus vulgaris L. seeds using desorption electrospray ionisation-imaging mass spectrometry. Sci. Rep. 7: 42977.

1137. Zhong, X., Yang, J., Shi, Y., Wang, X., and Wang, G.-L. (2017). The DnaJ protein OsDjA6 negatively regulates rice innate immunity to the blast fungus Magnaporthe oryzae. Mol. Plant Pathol.in press.

1138. Kan, C.-C., Chung, T.-Y., Wu, H.-Y., Juo, Y.-A., and Hsieh, M.-H. (2017). Exogenous glutamate rapidly induces the expression of genes involved in metabolism and defense responses in rice roots. BMC Genomics 18: 186.

1139. Tang, M. et al. (2017). The Nup98 homolog APIP12 targeted by the effector AvrPiz-t is involved in rice basal resistance against Magnaporthe oryzae. Rice 10: 5.

1140. Pelot, K.A. et al. (2017). Biosynthesis of the psychotropic plant diterpene salvinorin A: Discovery and characterization of the Salvia divinorum clerodienyl diphosphate synthase. Plant J. 89: 885–897.

1141. Li, C. et al. (2017). Gene expression and plant hormone levels in two contrasting rice genotypes responding to brown planthopper infestation. BMC Plant Biol. 17: 57.

1142. Žižková, E. et al. (2017). Control of cytokinin and auxin homeostasis in cyanobacteria and algae. Ann. Bot. 119: 151–166.

1143. Onaga, G. et al. (2017). High temperature effects on Pi54 conferred resistance to Magnaporthe oryzae in two genetic backgrounds of Oryza sativa. J. Plant Physiol. 212: 80–93.

1144. Fowble, K.L. et al. (2017). Development of “Laser Ablation Direct Analysis in Real Time Imaging” mass spectrometry: application to spatial distribution mapping of metabolites along the biosynthetic cascade leading to synthesis of atropine and scopolamine in plant tissue. Anal. Chem. 89: 3421–3429.

1145. Cheng, X.-X. et al. (2017). The endochitinase VDECH from Verticillium dahliae inhibits spore germination and activates plant defense responses. Plant Sci. 259: 12–23.

1146. Mori, Y. et al. (2017). Involvement of ralfuranones in the quorum sensing signalling pathway and virulence of Ralstonia solanacearum strain OE1-1. Mol. Plant Pathol. in press.

1147. Tan, W., Bartram, S., and Boland, W. (2017). Mechanistic studies of sesquiterpene cyclases based on their carbon isotope ratios at natural abundance. Plant Cell Environ. in press.

1148. Rocha, A.D., Vieira, H.D.S., Takahashi, J.A., and Boaventura, M.A.D. (2017). Synthesis of a new allelopathic agent from the biotransformation of ent-15α-hydroxy-16-kauren-19-oic acid with Fusarium proliferatum. Nat. Prod. Res. in press.

1149. Jain, P. et al. (2017). Understanding host-pathogen interactions with expression profiling of NILs carrying rice-blast resistance Pi9 gene. Front. Plant Sci. 8: 93.

1150. Xu, L. et al. (2017). ABNORMAL INFLUORESCENCE MERISTEM1 functions in salicylic acid biosynthesis to maintain proper reactive oxygen species levels for root meristem activity in rice. Plant Cell 29: 560–574.

1151. Zhou, J.-M., Tang, D., and Wang, G. (2017). Receptor kinases in plant pathogen interactions: more than pattern recognition. Plant Cell 29: 618–637.

1152. López-Díaz, C. et al. (2017). Fusaric acid contributes to virulence of Fusarium oxysporum on plant and mammalian hosts. Mol. Plant Pathol. in press.

1153. Schnippenkoetter, W. et al. (2017). The wheat Lr34 multi-pathogen resistance gene confers resistance to anthracnose and rust in sorghum. Plant Biotechnol. J. in press.

1154. Kong, L. et al. (2017). A Phytophthora effector manipulates host histone acetylation and reprograms defense gene expression to promote infection. Curr. Biol. 27: 981–991.

1155. Piasecka, A. et al. (2017). Drought-related secondary metabolites of barley (Hordeum vulgare L.) leaves and their metabolomic quantitative trait loci. Plant J. 89: 898–913.

1156. Cerrudo, I. et al. (2017). Exploring growth-defence trade-offs in Arabidopsis: phytochrome B inactivation requires JAZ10 to suppress plant immunity but not to trigger shade-avoidance responses. Plant Cell Environ. 40: 635–644.

1157. Nour-Eldin, H.H. et al. (2017). Reduction of antinutritional glucosinolates in Brassica oilseeds by mutation of genes encoding transporters. Nat. Biotechnol. 35: 377–382.

1158. Thakare, D., Zhang, J., Wing, R.A., Cotty, P.J., and Schmidt, M.A. (2017). Aflatoxin-free transgenic maize using host-induced gene silencing. Sci. Adv. 3: e1602382.

1159. Ogawa, S. et al. (2017). OsMYC2 mediates numerous defence-related transcriptional changes via jasmonic acid signalling in rice. Biochem. Biophys. Res. Commun. 486: 796–803.

1160. Lim, D.-S., Lim, D.-H., Lee, J.-H., Oh, E.-T., and Keum, Y.-S. (2017). Structure–oxidative metabolism relationships of substituted flavones by Aspergillus niger. J. Agric. Food Chem. 65: 3056–3064.

1161. Rai, A., Saito, K., and Yamazaki, M. (2017). Integrated omics analysis of specialized metabolism in medicinal plants. Plant J. 90: 764–787.

1162. Li, F.-q. et al. (2017). Expression of lima bean terpene synthases in rice enhances recruitment of a beneficial enemy of a major rice pest. Plant Cell Environ. in press.

1163. Henquet, M. et al. (2017). Identification of a drimenol synthase and drimenol oxidase from Persicaria hydropiper, involved in the biosynthesis of insect deterrent drimanes. Plant J. 90: 1052–1063.

1164. Hu, K. et al. (2017). Improvement of multiple agronomic traits by a disease resistance gene via cell wall reinforcement. Nat. Plants 3: 17009.

1165. Carotenuto, G. et al. (2017). The rice LysM receptor-like kinase OsCERK1 is required for the perception of short-chain chitin oligomers in arbuscular mycorrhizal signaling. New Phytol. in press.

1166. Decker, E.L. et al. (2017). Strigolactone biosynthesis is evolutionarily conserved, regulated by phosphate starvation and contributes to resistance against phytopathogenic fungi in a moss, Physcomitrella patens. New Phytol. in press.

1167. Nie, P. et al. (2017). Induced systemic resistance against Botrytis cinerea by Bacillus cereus AR156 through a JA/ET- and NPR1-dependent signaling pathway and activates PAMP-triggered immunity in Arabidopsis. Front. Plant Sci. 8: 238.

1168. Farag, M.A., Al-Mahdy, D.A., Meyer, A., Westphal, H., and Wessjohann, L.A. (2017). Metabolomics reveals biotic and abiotic elicitor effects on the soft coral Sarcophyton ehrenbergi terpenoid content. Sci. Rep. 7: 648.

1169. Pedras, M.S.C., and To, Q.H. (2017). Defense and signalling metabolites of the crucifer Erucastrum canariense: Synchronized abiotic induction of phytoalexins and galacto-oxylipins. Phytochemistry 139: 18–24.

1170. Jin, B. et al. (2017). Functional diversification of kaurene synthase-like genes. Plant Physiol. 174: 943–955.

1171. Fina, J. et al. (2017). UV-B inhibits leaf growth through changes in Growth Regulating Factors and gibberellin levels. Plant Physiol. 174: 1110–1126.

1172. Uchida, K., Akashi, T., and Aoki, T. (2017). The missing link in leguminous pterocarpan biosynthesis is a dirigent domain-containing protein with isoflavanol dehydratase activity. Plant Cell Physiol. 58: 398–408.

1173. Powell, J.J. et al. (2017). The Fusarium crown rot pathogen Fusarium pseudograminearum triggers a suite of transcriptional and metabolic changes in bread wheat (Triticum aestivum L.). Ann. Bot. 119: 853–867.

1174. Genot, B. et al. (2017). Constitutively active Arabidopsis MAP Kinase 3 triggers defense responses involving salicylic acid and SUMM2 resistance protein. Plant Physiol. 174: 1238–1249.

1175. Yu, C. et al. (2017). A ten gene-containing genomic island determines flagellin glycosylation: implication for its regulatory role in motility and virulence of Xanthomonas oryzae pv. oryzae. Mol. Plant Pathol. in press.

1176. Petitot, A.-S. et al. (2017). Transcriptomic and histological responses of African rice (Oryza glaberrima) to Meloidogyne graminicola provide new insights into root-knot nematode resistance in monocots. Ann. Bot. 119: 885–899.

1177. Marroquin-Guzman, M. et al. (2017). The Magnaporthe oryzae nitrooxidative stress response suppresses rice innate immunity during blast disease. Nat. Microbiol. 2: 17054.

1178. Uji, Y., Akimitsu, K., and Gomi, K. (2017). Identification of OsMYC2-regulated senescence-associated genes in rice. Planta 245: 1241–1246.

9/7-12/25 の輪読

実に 4 ヶ月近くブログをサボってしまいました．実は長谷川の個人的事情でしばらく更新できない時期があり，溜まってしまうと余計更新作業が億劫になってしまうので，ここまで更新なしになっていた次第です．このまま年を越すのはよろしくないので，とりあえず，輪読の題材のアップから取り掛かります．

この間，実は輪読も 9/12-10/18 の期間は完全にお休みしていますが，これまでの輪読では下記の論文を取り上げました．

823. Venkateshwaran, M. et al. (2015). A role for the mevalonate pathway in early plantsymbiotic signaling. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 112: 9781–9786.

824. Mirabella, R. et al. (2015). WRKY40 and WRKY6 act downstream of the green leaf volatile E-2-hexenal in Arabidopsis. Plant J. 83: 1082–1096.

825. Liebeke, M. et al. (2015). Unique metabolites protect earthworms against plant polyphenols. Nat. Commun. 6: 7869.

826. Naessens, E. et al. (2015). A secreted MIF cytokine enables aphid feeding and represses plant immune responses. Curr. Biol. 25: 1898–1903.

827. Zhang, D. et al. (2015). Repression of microRNA biogenesis by silencing of OsDCL1 activates the basal resistance to Magnaporthe oryzae in rice. Plant Sci. 237: 24–32.

828. Conn, C.E. et al. (2015). Convergent evolution of strigolactone perception enabled host detection in parasitic plants. Science 349: 540–543.

829. Yoshimoto, N. et al. (2015). Identification of a flavin-containing S-oxygenating monooxygenase involved in alliin biosynthesis in garlic. Plant J. 83: 941–951.

830. Lori, M. et al. (2015). Evolutionary divergence of the plant elicitor peptides (Peps) and their receptors: interfamily incompatibility of perception but compatibility of downstream signalling. J. Exp. Bot. 66: 5315–5325.

831. Plach, M.G., Löffler, P., Merkl, R., and Sterner, R. (2015). Conversion of anthranilate synthase into isochorismate synthase: implications for the evolution of chorismate-utilizing enzymes. Angew. Chem. Int. Ed. 54: 11270–11274.

832. Ng, J.L.P. et al. (2015). Flavonoids and auxin transport inhibitors rescue symbiotic nodulation in the Medicago truncatula cytokinin perception mutant cre1. Plant Cell 27: 2210–2226.

833. Frerot, E., Neirynck, N., Cayeux, I., Yuan, Y.H.-J., and Yuan, Y.-M. (2015). New umami amides: structure–taste relationship studies of cinnamic acid derived amides and the natural occurrence of an intense umami amide in Zanthoxylum piperitum. J. Agric. Food Chem. 63: 7161–7168.

834. Dadashipour, M., Ishida, Y., Yamamoto, K., and Asano, Y. (2015). Discovery and molecular and biocatalytic properties of hydroxynitrile lyase from an invasive millipede, Chamberlinius hualienensis. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 112: 10605–10610.

835. Wang, H. et al. (2015). Rice WRKY4 acts as a transcriptional activator mediating defense responses toward Rhizoctonia solani, the causing agent of rice sheath blight. Plant Mol. Biol. 89: 157–171.

836. Zhang, F. et al. (2015). Structural basis of JAZ repression of MYC transcription factors in jasmonate signalling. Nature 525: 269–273.

837. Ishiga, Y. et al. (2015). Transcriptomic and metabolomic analyses identify a role for chlorophyll catabolism and phytoalexin during Medicago nonhost resistance against Asian soybean rust. Sci. Rep. 5: 13061.

838. Lemarié, S. et al. (2015). Camalexin contributes to the partial resistance of Arabidopsis thaliana to the biotrophic soilborne protist Plasmodiophora brassicae. Front. Plant Sci. 6: 539.

839. Strugala, R., Delventhal, R., and Schaffrath, U. (2015). An organ-specific view on nonhost resistance. Front. Plant Sci. 6: 526.

840. Galanie, S., Thodey, K., Trenchard, I.J., Filsinger Interrante, M., and Smolke, C.D. (2015). Complete biosynthesis of opioids in yeast. Science 349: 1095–1100.

841. Patkar, R.N. et al. (2015). A fungal monooxygenase-derived jasmonate attenuates host innate immunity. Nat. Chem. Biol. 11: 733–740.

842. Speed, M.P., Fenton, A., Jones, M.G., Ruxton, G.D., and Brockhurst, M.A. (2015). Coevolution can explain defensive secondary metabolite diversity in plants. New Phytol. 208: 1251–1263.

843. Byeon, Y., Choi, G.-H., Lee, H.Y., and Back, K. (2015). Melatonin biosynthesis requires N-acetylserotonin methyltransferase activity of caffeic acid O-methyltransferase in rice. J. Exp. Bot. 66: 6917–6925.

844. Clausen, M. et al. (2015). The bifurcation of the cyanogenic glucoside and glucosinolate biosynthetic pathways. Plant J. 84: 558–573.

845. Rodiuc, N. et al. Evolutionarily distant pathogens require the Arabidopsis phytosulfokine signalling pathway to establish disease. Plant Cell Environ. in press.

846. Kettle, A.J. et al. (2015). A γ-lactamase from cereal infecting Fusarium spp. catalyses the first step in the degradation of the benzoxazolinone class of phytoalexins. Fungal Genet. Biol. 83: 1–9.

847. Hidalgo, W., Chandran, J.N., Menezes, R.C., Otálvaro, F., and Schneider, B. Phenylphenalenones protect banana plants from infection by Mycosphaerella fijiensis and are deactivated by metabolic conversion. Plant Cell Environ. in press.

848. Moghe, G., and Last, R.L. (2015). Something old, something new: Conserved enzymes and the evolution of novelty in plant specialized metabolism. Plant Physiol. 169: 1512–1523.

849. Tsuchiya, Y. et al. (2015). Probing strigolactone receptors in Striga hermonthica with fluorescence. Science 349: 864–868.

850. Olate, V.R., Vélez, M.L., Greslebin, A., and Schmeda-Hirschmann, G. (2015). Phytophthora austrocedri elicitates changes in diterpene profile of Austrocedrus chilensis. Molecules 20: 15084–15097.

851. Falcone Ferreyra, M.L. et al. (2015). The identification of maize and Arabidopsis type I FLAVONE SYNTHASEs links flavones with hormones and biotic interactions. Plant Physiol. 169: 1090–1107.

852. Zheng, S. et al. (2015). Evaluating the effect of expressing a peanut resveratrol synthase gene in rice. PLoS ONE 10: e0136013.

853. Christensen, S.A. et al. (2015). Maize death acids, 9-lipoxygenase–derived cyclopente(a)nones, display activity as cytotoxic phytoalexins and transcriptional mediators. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 112: 11407–11412.

854. Ryffel, F. et al. Metabolic footprint of epiphytic bacteria on Arabidopsis thaliana leaves. ISME J. in press.

855. Zamioudis, C. et al. (2015). Rhizobacterial volatiles and photosynthesis-related signals coordinate MYB72 in Arabidopsis roots during onset of induced systemic resistance and iron deficiency responses. Plant J. 84: 309–322.

856. Hadwiger, L.A. (2015). Nonhost resistance: Self-inflicted DNA damage by fungal DNase accumulation is a major factor in terminating fungal growth in the pea-Fusarium solani f.sp. phaseoli interaction. Physiol. Mol. Plant Pathol. 92: 79–87.

857. Chamam, A., Wisniewski-Dyé, F., Comte, G., Bertrand, C., and Prigent-Combaret, C. (2015). Differential responses of Oryza sativa secondary metabolism to biotic interactions with cooperative, commensal and phytopathogenic bacteria. Planta 242: 1439–1452.

858. Rasher, D.B. et al. (2015). Marine and terrestrial herbivores display convergent chemical ecology despite 400 million years of independent evolution. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 112: 12110–12115.

859. Ray, S. et al. (2015). Maize plants recognize herbivore-associated cues from caterpillar frass. J. Chem. Ecol. 41: 781–792.

860. Li, R. et al. (2015). Prioritizing plant defence over growth through WRKY regulation facilitates infestation by non-target herbivores. eLife 4: e04805.

861. Pedras, M.S.C., Alavi, M., and To, Q.H. (2015). Expanding the nasturlexin family: Nasturlexins C and D and their sulfoxides are phytoalexins of the crucifers Barbarea vulgaris and B. verna. Phytochemistry 118: 131–138.

862. Siciliano, I., Amaral Carneiro, G., Spadaro, D., Garibaldi, A., and Gullino, M. (2015). Jasmonic acid, abscisic acid and salicylic acid are involved in the phytoalexin responses of rice to Fusarium fujikuroi, a high gibberellin producer pathogen. J. Agric. Food Chem. 63: 8134–8142.

863. Xiao, G.-Q., Zhang, H.-W., Lu, X.-Y., and Huang, R.-F. (2015). Characterization and mapping of a novel light-dependent lesion mimic mutant lmm6 in rice (Oryza sativa L.). J. Integr. Agric. 14: 1687–1696.

864. Alamgir, K.M. et al. Systematic analysis of rice (Oryza sativa) metabolic responses to herbivory. Plant Cell Environ. in press.

865. Qi, J. et al. Jasmonic acid carboxyl methyltransferase regulates development and herbivory-induced defense response in rice. J. Integr. Plant Biol. in press.

866. Hu, L. et al. (2015). The rice transcription factor WRKY53 suppresses herbivore-induced defenses by acting as a negative feedback modulator of mitogen-activated protein kinase activity. Plant Physiol. 169: 2907–2921.

867. Scholz, S.S., Reichelt, M., Boland, W., and Mithöfer, A. (2015). Additional evidence against jasmonate-induced jasmonate induction hypothesis. Plant Sci. 239: 9–14.

868. Poloni, A., and Schirawski, J. Host specificity in Sporisorium reilianum is determined by distinct mechanisms in maize and sorghum. Mol. Plant Pathol. in press.

869. Klein, A.P., and Sattely, E.S. (2015). Two cytochromes P450 catalyze S-heterocyclizations in cabbage phytoalexin biosynthesis. Nat. Chem. Biol. 11: 837–839.

870. Poreddy, S. et al. (2015). Detoxification of hostplant/’s chemical defence rather than its anti-predator co-option drives β-glucosidase-mediated lepidopteran counteradaptation. Nat. Commun. 6: 8525.

イネのフィトアレキシンのページ開設 & 今週の輪読

研究室ウェブサイトに新たなコンテンツとして「イネのフィトアレキシン」というページを作りました．イネフィトアレキシンに関する色々な情報を掲載していこうと考えていますが，まずは関連する文献リストを最初のコンテンツとして公開しました．このリストもまだ不完全ですが，順次アップデートしていく予定です．

新年度の新しいメンバーで今週から輪読がスタートしました．今週の輪読では下記の論文を取り上げました．

283. Zheng, Z. et al. (2013). Coordination of auxin and ethylene biosynthesis by the aminotransferase VAS1. Nat. Chem. Biol. 9: 244–246.
284. Quandt, E.M. et al. Decaffeination and measurement of caffeine content by addicted Escherichia coli with a refactored N-demethylation operon from Pseudomonas putida CBB5. ACS Synth. Biol. in press.
285. Vaughan, M.M. et al. Formation of the unusual semivolatile diterpene rhizathalene by the Arabidopsis class I terpene synthase TPS08 in the root stele is involved in defense against belowground herbivory. Plant Cell in press.
286. Ejike, C.E.C.C., Gong, M., and Udenigwe, C.C. Phytoalexins from the Poaceae: Biosynthesis, function and prospects in food preservation. Food Res. Int. in press.
287. Mutka, A.M., Fawley, S., Tsao, T., and Kunkel, B.N. Auxin promotes susceptibility to Pseudomonas syringae via a mechanism independent of suppression of salicylic acid-mediated defenses. Plant J. in press.

研究室セミナー再開，BiND5

8 月中は夏休みのため開催していなかった研究室セミナーが今日から再開されました．9 月中は実験の進捗状況の報告のみで，論文紹介は 10 月再開予定です．大学の授業は 9 月いっぱい夏休みですが，研究室は 9 月はほぼ通常通り営業中です．

研究室のホームページの更新をしばらくしていませんでしたが，更新に使用していた BiND4 が Mac OS X 10.7 Lion に対応していなかったのに，私が Lion をインストールしてしまったのが原因です．今日，やっと Lion に対応した BiND5 が届いたので，久しぶりに更新してデザインもちょっと変更しました．

最近の生物制御化学研究室

今日で 8 月も終了ですが，7, 8 月とブログを全く書いていませんでした．Twitter では毎日研究室の状況などをツイートしているのですが，Twitter 中心になると，やはりブログ更新は後回しになってしまいます．しかし，Twitter はリアルタイム性には優れていますが，ブログの方があとで参照しやすいので，忘れないうちに 7, 8 月の研究室の近況を記録しておきます．

7/3

　資源生物科学科ソフトボール大会でブービー賞（昨年は優勝）．

7/7

　GC-MS が不調に陥りました．イオン化室の温度が上がらないという問題で，ヒーターを交換しても駄目だったので，結局，日本電子に来てもらって 7/23 に基板交換しました．修理費用は 15 万円弱．

7/9

　農学部広報推進チームに所属している長谷川がオープンキャンパスの宣伝のため，高校訪問（水戸一高，二高，三高，水城高）をしました．

7/15

　長谷川が磐城桜が丘高校で模擬授業を実施してきました．

7/18

　茨城大学農学部オープンキャンパス開催．農学部全体の来客数は昨年並みでしたが，生物制御化学研究室を見学に来た学生さんは昨年より少なかったようです．長谷川は農学部説明会を担当して，研究室の四年生の佐藤さんにも発表してもらいました．

7/20

　長年使ってきたクロマトチャンバーが壊れてしまったので，新しい冷凍冷蔵庫を買いました．大分前に発注していたのですが，この日にやっと届きました．シャープ製の家庭用製品で「プラズマクラスター」とかいう謎の機能が付いています．

左が壊れたクロマトチャンバー，右が新しいプラズマクラスター機能付き冷凍冷蔵庫

7/21

　NMR の液体窒素供給装置が不調に陥りました．一度，メーカーの日本サーマルエンジニアリングに見てもらったのですが，まだ調子が悪く，NMR に供給する分の液体窒素は何とかなるのですが，外部供給量が大分落ちてしまいました．9/8 に再度修理してもらう予定です．

7/24

　水戸キャンパスで茨城大学オープンキャンパス開催．長谷川は農学部説明会を担当しました．今回も研究室の佐藤さんに手伝ってもらいました．

7/30

　連合農学研究科教授会で戸嶋先生と長谷川も東京農工大学に出張してきました．

8/2

　農学部では期末試験終了．夕方，生協でビアホール開催．長谷川は仕事があって行けなかったのですが，戸嶋先生と研究室の学生さんたちは楽しんできたようです．

8/3-4

　八丁堀の AB SCIEX で LC-MS/MS のトレーニングを長谷川が化学生態学研究室の鈴木先生と一緒に受けてきました．中級定量トレーニングということでしたが，大体分かっていることの復習でした．

8/6

　水戸の一年生向けの専門科目「化学生態学入門」の期末試験．成澤先生と一緒に試験監督をやってきました．

8/9

　茨城大学大学院農学研究科の大学院入試．研究室の四年生は 2 名が受験しました．8/27 に合格発表がありましたが，2 名とも見事に合格です．

8/17-19

　AB SCIEX で LC-MS/MS のトレーニングを長谷川が受講してきました．今回は 3200 QTRAP のトラップの機能を使った定性トレーニングで，新しいことをいろいろ学べました．また，LightSight という導入時に付けてもらったソフトウェアが結構使えるソフトであることがわかったのが収穫でした．

8/20

　戸嶋先生がつくばの研究交流センターで開催された農学部夏のサテライトで講演をしました．

8/24

　お世話になっている鈴木義人先生の化学生態学研究室がホームページを開設しました．

8/27

　茨城大学農学部三年次編入学試験が開催．大学院入試の合格発表．

8/30

　筑波大学で開催された日本化学会第 4 回関東支部大会で大学院生の井坂君と下村君がポスター発表をしました．

ブログ放置しすぎました

研究室のブログを一ヶ月以上放置してしまいました．最近はちょっとした情報発信はすべて Twitter で行っているので，なかなかブログを書く機会がありませんでした．まとめて研究室の近況報告です．

新年度が開始して一ヶ月半が経過しましたが，研究室では今年度就職希望者 2 名（四年生・修士課程各 1 名）はすでに内定をもらって卒論・修論研究に励んでいます．四年生 2 名が大学院進学希望です．

今年 3 月で満期退学した社会人入学の博士課程学生の湯本さんは 9 月修了のために 6 月初めの論文提出を目指して準備中です．

今年度の研究予算では戸嶋先生が科学研究費補助金基盤研究(C)を新規で獲得することができました（長谷川は残念ながら不採択）．

4 月に二研（戸嶋先生所属の学生さんたちの使っている実験室）の分電盤のブレーカーが火を噴くという事故がありました．原因はまだ調査中ですが，幸い昼間で学生さんが研究室にいるときに起こったので，大事に至らずに済みました．夜中だったとしたらかなり大きな火災になっていた可能性が大きかったと思います．でもその後一週間以上は二研では電気が使えず，かなり実験に支障を来してしまいました．

研究室のゼミには今年度から化学生態学研究室の鈴木先生と鈴木先生所属の四年生の山口君も参加してもらっています．連休前に年間計画発表会を行い，連休明けからは文献紹介のゼミも始まりました．

文献紹介ゼミは先週は博士課程の井坂君が担当で，紹介した論文は Jhillu Singh Yadav, Gunda Gopala Krishana and Satya Narayana Kumar, A concise stereoselective formal total synthesis of the cytotoxic macrolide (+)-Neopeltolide via Prins cyclization. Tetrahedron, 66(2), 480-487 (2010) でした．

今週は修士課程の下村君が担当で，紹介した論文は Matthew Brichacek, Lindsay A. Batory, Nicholas A. McGrath and Jon T. Njardarson, The strategic marriage of method and motif. Total synthesis of varitriol. Tetrahedron, in press でした．

また，先週から一研の学生 2 名と長谷川で NMR の勉強会を始めました．せっかく最新の 400 MHz NMR が導入されたので有効利用するためという意味合いもありますし，ちょうど 2 人とも新しい化合物の構造解析をしなければ行けない必要性に迫られているところでもあるので，ちょうど良いタイミングだと思います．テキストは Kwan, E.E., and Huang, S.G., Structural elucidation with NMR spectroscopy: practical strategies for organic chemists. European Journal of Organic Chemistry, 2008, 2671-2688 (2008) を用いています．

Twitter 始めました

生物制御化学研究室の Twitter を始めました．ブログだけだとなかなか更新頻度を上げられないので，Twitter で気軽に情報発信できれば良いかなとも思い，始めてみることにしました．

ページデザインをまた変更

一週間前に変えたばかりなのですが，ちょっと気に入らない点（ブラウザによってレイアウトがちょっとおかしい）があったので，またデザインを変更しました．印象を変えて暗いバックに白文字にしてみました．

ホームページのデザインを変更

しばらくぶりにホームページに新しい情報（学会と鍬耕祭）を掲載しました．トップページの桜の写真もさすがに飽きてきたので，ページデザインも変更してみました．

3000 アクセス

昨日，この「生物制御化学研究室の日々」が 3000 アクセスに到達しました．2000 アクセスからはちょうど 2 ヶ月かかりました．1000 から 2000 は 40 日ちょっとだったので，ややアクセス数が落ちているようですが，これはアセトニトリルの問題を検索してこのページに来る人が以前は結構いたためだと思われます．

ブログ移行完了

「生物制御化学研究室の日々」過去記事の Blogger への移行が完了しました．BiND for WEBLiFE* 2.5 の SYNC という機能を使って作成しているのですが，難点は RSS フィードのリンクが自動的に作られないのと，過去記事へはカレンダーを使ってアクセスするしかない点です．

RSS フィードが欲しい人や過去記事をもっと簡単に参照したい方は Blogger の方へ直接アクセスして下さい．

「生物制御化学研究室の日々」を Blogger に移行

「生物制御化学研究室の日々」は今まで RapidWeaver というソフトを使って更新していましたが，研究室のホームページ更新に使っている BiND というソフトが Blogger に対応したので，移行することにしました．

RapidWeaver は使いやすくて良いソフトなのですが，ブログの置き場所を大学のサーバーにしていると，学外から更新ができないという問題がありました．Blogger ならば，家からでも出張先からでも更新できるので，便利になりそうです．その他，技術的な点は後ほど個人ブログに書きます．

旧ブログもしばらくは残しておきますが，徐々に過去記事も Blogger にコピーしていきたいと思います．

温湯イチゴのホームページ

FS センターの佐藤先生が研究代表者をされている新たな農林水産政策を推進する実用技術開発事業「温湯散布による施設イチゴの農薬使用量削減と保鮮技術の確立」のホームページが開設されました．

50～60℃ のお湯をかけることによってイチゴの病害虫を防除するという技術の開発を目指した研究プロジェクトです．私も研究を分担していますが，今年度は人手不足であまりお手伝いができませんでした．4 月からは新四年生にこのイチゴ関連の卒業論文研究に取り組んでもらおうと思っています．佐藤先生のところの実験で非常に興味深い結果がすでに出ているので，当研究室でも面白い研究成果を出せるのではないかと期待しています．

ブログテーマ変更

三月になりましたが，茨城はまだかなり寒いです．気分だけでも春らしくするために，ブログテーマを「Realmac Software ’07」というのに変更しました．

2000 アクセス

昨日から今日にかけてこのブログのアクセスが 2000 を超えました．1000 アクセス突破は 1/9 でしたので，40 日ちょっとで 1000 アクセス稼いだことになります．一日平均にすると 20 アクセス以上ということです．おそらく定期的に見てくれているのは現在の研究室関係者と OB & OG の皆さんだと思いますが，これからも細々と続けていきますので，あまり期待しないで見に来て下さい．

1000 アクセス突破

今日はブログに書くネタがないなあと思っていたのですが，さきほど確認するとこのブログのアクセス数が 1000 を超えていましたので，その件について書きます．

この年末ぐらいからこのブログのアクセス数が急に増えていて多い日には１日当たり 50 アクセス以上あります．

原因をいろいろ考えたのですが，なぜかよく分からずにいました．先日卒業生から「ブログを読みました」といって久しぶりにメールをもらいましたが，このブログにたどり着いたのは「アセトニトリル　供給」で MSN Live Search を検索したからだと教えてくれました．アセトニトリルの供給不足についてちょっと前に書きましたが，このページはこの検索ワードでは現在３件目にリストされます．ちなみにグーグルでも１ページ目です．

急にアクセスの増えた原因はどうもこのあたりにありそうです．

生物制御化学研究室HP 1000 アクセス

先ほど確認すると，このブログの親ページである生物制御化学研究室ホームページが 1004 アクセスになっていました．
7 ヶ月ちょっとで 1000 アクセスなので，一日平均 4～5 アクセスというところでしょうか．ちなみに現在 Google で「生物制御化学研究室」または「生物制御化学」で検索すると，うちの研究室は農工大，東大の生物制御化学研究室に続いて三番目に表示されます．